El territorio Mapu Lahual alberga una vasta área de bosque templado lluvioso rico en biodiversidad. La gran variedad de especies nativas que se encuentra en esta zona proviene, en parte, de su historia como refugio glaciar. La Cordillera de la Costa en estas regiones no fue alcanzada por la última gran glaciación ocurrida unos 12.000 años atrás, la cual, en cambio, sí afectó a la Cordillera de los Andes y al Valle Central. Así, los antiguos bosques costeros fueron el lugar desde el cual las distintas especies de flora y fauna recolonizaron la Depresión Intermedia y la Cordillera de los Andes.
Mapu Lahual está inserto en la Cordillera de la Costa en la Región de los Lagos y Volcanes que, junto con la Región de los Ríos, forma la última extensión importante de bosques costeros primarios del país. Más al norte, estos bosques prácticamente han desaparecido de la Cordillera de la Costa.
Mapu Lahual abarca numerosos elementos que aseguran la conservación adecuada de la biodiversidad marina del Pacífico Templado Sudoriental, ya que se ubica en una zona de transición entre dos provincias oceánicas mayores: la Región Templada Cálida en el norte subtropical y la Región Templada Fría en el sur sub-antártica. Debido a esto, la biodiversidad del área ni tiene paralelo a lo largo del litoral del Pacífico Sudoriental.
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